02/out/2017
As novas tecnologias de sequenciamento de DNA de larga escala geraram uma revolução na comunidade científica e permitiram um aumento exponencial na quantidade de informação biológica gerada e na qualidade dos estudos. Uma das áreas que têm crescido bastante nos últimos anos é a análise da composição de microbiomas, nos mais diferentes domínios: humano, ambiental, alimentar, etc.
Nesta nova coluna quinzenal, a equipe técnica da Neoprospecta faz uma seleção das mais recentes publicações científicas de alto impacto, com foco em microbioma.
Urbanização, microbiota e doenças
O processo de surgimento e crescimento de cidades – ou urbanização – gera um aumento na densidade demográfica, mudanças na dieta dos indivíduos e diminuição de atividades físicas. Esses itens combinados culminam no aumento do risco de doenças como obesidade, diabetes, doenças cardiovasculares e câncer. Este estudo apresenta uma investigação sobre as diferenças de composição microbiológica do intestino de indivíduos do meio urbano e rural da China, além de análises do metaboloma do plasma, biomarcadores de saúde e hábitos de alimentação.
Recent urbanization in China is correlated with a Westernized microbiome encoding increased virulence and antibiotic resistance genes
Microbiome
https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-017-0338-7
Modulação do microbioma intestinal utilizando fibras dietéticas
O desequilíbrio da composição microbiana intestinal, conhecida por disbiose, está associada diversos distúrbios como a Doença Inflamatória Intestinal e a Doença Celíaca. A utilização de prebióticos – compostos capazes de estimular o crescimento e/ou metabolismo das bactérias benéficas – é uma opção para prevenir ou tratar estes desequilíbrios no microbioma do trato gastrointestinal. Os pesquisadores testaram a influência da suplementação da dieta com três fibras dietéticas, como inulina, amido resistente e pectina cítrica na composição bacteriana intestinal de ratos.
How to Feed the Mammalian Gut Microbiota: Bacterial and Metabolic Modulation by Dietary Fibers
Frontier in Microbiology
http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2017.01749/ful
Microbioma oral herdado x Doenças
A cárie dentária é uma doença crônica mais comum em crianças e é de origem multifatorial. Trata-se da desmineralização dental causada por ácidos produzido pela fermentação bacteriana dos carboidratos da dieta. Por tal razão, é muito importante conhecer a microbiota oral e compreender a influência de fatores ambientais e genéticos na sua composição. Esta pesquisa, publicada na Cell Host and Microbe, faz uma análise pareada do microbioma de 485 gêmeos monozigóticos e dizigóticos com e sem cáries, e evidencia a relação entre microbioma oral, fatores hereditários e cárie.
Host Genetic Control of the Oral Microbiome in Health and Disease
Cell Host and Microbe
http://www.cell.com/cell-host-microbe/pdf/S1931-3128(17)30346-3.pdf
Tempero espanhol desvendado
O Chorizo de León é um embutido curado e defumado, produzido na região de Castilla y León, na Espanha. O processo fermentativo pelo qual o produto é submetido confere aromas e sabores diferenciados, além de ser uma estratégia tradicionalmente utilizada para preservação da carne, devido a diminuição do pH, baixa atividade de água e produção de compostos antimicrobianos pelas bactérias presentes. Neste estudo, pesquisadores utilizam sequenciamento de DNA high-throughput (alto desempenho) para avaliar a diversidade microbiana envolvida neste processo de maturação do Chorizo de León, chegando ao nível de espécie.
High-throughput sequencing analysis reveals different Lactobacillus populations that dominate during “Chorizo de León” cured meat making
Food Microbiology
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0740002017304859
O DNA como fonte de informação microbiológica em alimentos
Os recentes avanços das novas tecnologias de sequenciamento de DNA permitiram que pesquisadores caracterizem o microbioma presente em determinados ambientes com maior facilidade e sensibilidade. Por meio de técnicas como sequenciamento do marcador genético rDNA 16S, metagenômica e metatranscritômica, é possível compreender a nível de espécie os microrganismos relacionados a diversos tipos de alimentos e suas interações funcionais. Neste artigo, os autores fazem uma revisão sobre essa tecnologia e sua aplicabilidade na área de alimentos.
A Review on the Applications of Next Generation Sequencing Technologies as Applied to Food-Related Microbiome Studies
Frontiers in Microbiology
http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2017.01829/full
Enxergando o invisível: metagenoma de organismos não-cultiváveis
O cultivo de microrganismos sempre foi um grande limitante para estudos de diversidade microbiológica, já que os métodos clássicos dependem de crescimento e cada microrganismo tem demandas nutricionais e ambientais distintas, muitas vezes não reproduzíveis em laboratório. No entanto, as técnicas de sequenciamento de DNA de nova geração (NGS) possibilitam identificar os microrganismos “não-cultiváveis” por meio de sua sequência de DNA e descobrir formas de vida ainda não conhecidas. Nessa pesquisa, os cientistas apresentam quase 8000 novos metagenomas, que aumentam a diversidade filogenética de bactérias e arqueas em mais de 30%.
Recovery of nearly 8,000 metagenome-assembled genomes substantially expands the tree of life
Nature Microbiology
https://www.nature.com/articles/s41564-017-0012-7
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